2009年YZF-R1首度將使用于廠車M1的cross-plane十字式曲軸設(shè)計，列入標(biāo)準(zhǔn)配備。十字式曲軸的橫切面呈十字形，有別于并列四汽缸的一字曲軸，特色是可以實(shí)現(xiàn)非對稱式的點(diǎn)火間斷時間，以制造車手擁有更多主動權(quán)的扭力。09年的YZF-R1的四個汽缸都是獨(dú)立運(yùn)作，除了在低轉(zhuǎn)時有充沛的扭力之外，在全區(qū)域轉(zhuǎn)數(shù)也有優(yōu)異的表現(xiàn)。為了配合非對稱式點(diǎn)火間斷，新R1的供油程序也作出相應(yīng)修改，發(fā)展出四組獨(dú)立的供油和點(diǎn)火時間。

2009 Yamaha YZF-R1

      此外，09年的YZF-R1也搭載全新制作的鋁金金DeltaBox車架，和鎂合金尾搖臂，以不同的材質(zhì)來做出平衡的剛性。同時，整體車身也變得較緊湊小巧，新的布局不僅提升了高速的穩(wěn)定性和整體的操控性，更有利出彎時對后輪牽引力的掌握和發(fā)揮。